Kamis, 27 Juni 2013 malam, pendaftaran calon pelajar di Pondok Modern Darussalam Gontor (PMDG) Putri 2 ditutup. Hal ini dilakukan untuk memaksimalkan bimbingan persiapan ujian lisan yang insya Allah akan dimulai dari Jum’at, 19 Juli 2013 s/d Rabu, 24 Juli 2013. Usai ujian lisan, capel akan diberikan bimbingan untuk materi-materi ujian tulis hingga 17 Ramadhan 1434. Sedangkan liburan akan dimulai sejak 18 Ramadhan 1434 hingga 10 Syawwal 1434. Dan untuk ujian tulis, akan dilaksanakan pada tanggal 15 Syawwal 1434. Dan rencananya, pengumuman hasil ujian masuk di Pondok Modern Darussalam Gontor (PMDG) Putri 2 akan dilaksanakan pada 22 Syawwal 1434.
Pada Kamis (27/6/2013) malam, jumlah pendaftar mencapai 2483 orang, 112 orang capel lebih banyak dari jumlah pendaftar tahun lalu. 1638 orang diantaranya lulusan Sekolah Dasar (SD/Sederajat), 843 orang lulusan Sekolah Menengah Pertama (SMP/Sederajat) dan 2 orang lainnya lulusan SMA. Seluruh calon pelajar tersebut dibagi dalam 40 kelas bimbingan yang sesuai dengan nilai hasil ujian penempatan kelas saat mereka mendaftar, 13 kelas untuk capel lulusan SMP/sederajat dan 37 kelas lainnya untuk capel lulusan SD/sederajat.
Dikarenakan kapasitas asrama yang tidak mencukupi, Sebanyak 902 Calon Santri terpaksa disebar ke 35 ruang kelas di gedung Granada dan Al-Azhar yang dijadikan asrama darurat, sementara kegiatan belajar mengajar di alihkan di depan-depan asrama.