Yayasan Pemeliharaan dan Perluasan Wakaf Pondok Modern (YPPWPM) adalah lembaga yang bergerak dalam bidang penggalian dana, pemeliharaan, perluasan, dan pengembangan wakaf Pondok . Saat ini Pondok Modern telah memiliki tanah wakaf 1025 ha, dan berbagai macam usaha ekonomi produktif untuk menopang kemandirian Pondok. Ketua Yayasan Pemeliharaan dan Pengembangan Wakaf Pondok Modern adalah K.H. Imam Shobari, S.Ag.
Di antara unit usaha ekonomi produktif yang dikembangkan oleh YPPWPM adalah: pusat produksi (percetakan dan penerbitan buku, air minum kemasan, konveksi pakaian, pabrik roti, mie, sandal, tempe, tahu, selep, pabrik es), pertokoan (toko bahan bangunan, kelontong, kebutuhan konsumsi sehari-hari, alat-alat olah raga, buku bacaan dan pelajaran, apotik, foto copy, perkulakan sayur-sayuran, pemotongan ayam, kantin makanan dan minuman, pusat grosir), jasa (Wisma Darussalam, balai kesehatan, travel dan transportasi, wartel, dan computer centre), pertanian (ratusan hektar sawah), perkebunan (550 hektar kebun kelapa sawit, coklat dan merica), dan pengelolaan hutan (90.000 hektar), serta peternakan (penggemukan sapi dan sapi perah). Unit usaha ekonomi produktif ini selain didirikan di kampus pusat, juga dikembangkan di kampus-kampus cabang lainnya.
